扣缴个人所得税是指根据国家相关法规，雇主或支付机构在发放工资、薪金、奖金等个人所得时，按照规定比例扣除个人应缴纳的税款，并将剩余部分支付给个人。以下是扣缴个人所得税的大致运行过程：

1. 确定纳税人身份：根据国家税务部门的规定，确定个人是否应纳个人所得税，以及适用的税率和起征点等。

2. 制定纳税计算公式：根据国家税法和相关规定，制定适用于不同收入等级的个人所得税计算公式。

3. 确定个人应纳税所得额：根据个人的收入来源和扣除项目，计算个人应纳税所得额。收入来源包括工资、薪金、奖金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费、利息、股息、房屋租金等。

4. 计算应缴纳的个人所得税：根据个人所得额和适用税率，计算个人应缴纳的个人所得税。税率一般为分级递进，随着个人所得额的增加而逐渐增加。

5. 扣缴个人所得税：雇主或支付机构根据个人所得税计算结果，从个人所得中直接扣除应缴纳的个人所得税，并将剩余部分支付给个人。

6. 缴纳个人所得税：雇主或支付机构需要按照规定的时间周期，将扣缴的个人所得税上缴给国家税务部门。

7. 报告纳税情况：雇主或支付机构需要按照规定，向国家税务部门报告扣缴个人所得税的相关情况，包括纳税人的身份信息、收入情况、扣缴金额等。

总体来说，扣缴个人所得税的运行是通过雇主或支付机构作为中介机构，按照国家税法规定，从个人所得中扣除应缴纳的个人所得税，然后将剩余部分支付给个人，最终将扣缴的个人所得税上缴给国家税务部门。这一过程旨在确保个人按照法律规定缴纳个人所得税，维护国家税收秩序，支持国家公共事业的发展。